Dans la jungle d’un pays nommé la Palombie vit un drôle d’animal au pelage jaune à pois noirs : le Marsupilami ! Doté d’une queue longue de plusieurs mètres lui permettant de se déplacer en sautant, d’attraper des objets, de se défendre ou de simplement s’amuser, il mène une existence paisible mais toujours amusante avec sa compagne et leurs trois petits. Mais cette vie insouciante pourrait bien prendre fin suite à l’arrivée d’une milliardaire mégalomane et peu soucieuse de l’environnement, Félicia Devort. Aidée de ses sbires Blouprint et Stroy, celle-ci projette en effet de raser la jungle pour y implanter une gigantesque mégalopole...
Heureusement les marsus peuvent compter sur leurs amis Diane, une passionnée de la nature (et en particulier d’une plante très rare, le Immobilis Tempus), et son jeune neveu Hector pour les aider à contrer les projets insensés de Félicia...