Octobre 1894. Une affaire d'Etat fait la une des journaux : un espion livre des secrets militaires à l'Allemagne !
22 décembre 1894. Le capitaine Alfred Dreyfus est condamné par un tribunal militaire à la dégradation publique et à la déportation à vie. On l'a déclaré coupable de haute trahison. Il se dit innocent !
L'affaire va diviser la France. Des émeutes éclateront et les plus hautes autorités de l'Etat seront touchées par le scandale. Il faudra attendre douze ans pour que Dreyfus soit réhabilité dans tous ses droits, l'Etat français reconnaissant son erreur.
Mais s'agissait-il d'une erreur ou bien d'un complot ?
Dreyfus fut condamné sur la base d'un dossier secret que seuls les juges militaires eurent à l'époque le droit de consulter. Il contenait, disait-on, les preuves irréfutables de la culpabilité de Dreyfus. Pour la première fois, les auteurs du film ont eu l'autorisation de filmer ce dossier – conservé dans un coffre-fort des archives du ministère de la Défense. Ce que l'enquête va révéler, c'est l'ampleur insoupçonnée de la manipulation montée par les plus hauts responsables de l'Etat et de l'armée. Le dossier secret est un dossier fabriqué de toutes pièces et constitué de faux documents...