Quirke, le personnage principal, est le médecin responsable de la morgue à Dublin dans les années 50. C'est un personnage solitaire et charismatique, que son métier conduit à mener des enquêtes sur des morts mystérieuses.
Lors de chaque épisode, il tente de comprendre ce qui est arrivé à des personnes qui finissent dans sa morgue et il doit s'enfoncer dans les profondeurs de Dublin à la recherche de réponses. Ces enquêtes sont aussi l'occasion pour lui de de se replonger dans son propre passé, et de dévoiler une histoire familiale compliquée alors qu'il tente de renouer des liens avec sa fille qui a été élevée par sa tante et son oncle.