Dans un avenir proche, lors de recherches sur un site babylonien, Delphius, un scientifique va commettre un acte terroriste en déclenchant un pouvoir inconnu jusqu'alors. Ce qu'on appelera Twin X provoqua un orage magnétique couvrant la planéte d'un ciel opaque, bloquant ainsi toute source d'éléctricité.
Quelques années après, les deux enfants du scientifique, Kiyoko et Tatsuya, vont se retrouver convoiter par deux groupes dont l'enjeu est l'avenir du monde, la Comptesse de Werdenberg et ses ados aux pouvoirs telekinesiques et le mystérieux Gilgamesh.