Suite à l'attaque surprise de Ba'al, les Réplicateurs ont infecté le système de sauvegarde des esprits des Asgards et menacent leur empire. A bord du vaisseau Thor, Teal'c et Daniel fusionnent l'esprit du Colonel O'Neal avec le savoir des Anciens créant ainsi une arme de défense pour contrer l'invasion. Ils doivent également porter secours à Sam, retenue prisonnière dans le monde virtuel de Numéro 5...