Après 12 années d'égémonie dans le monde du DMMO-RPG, le jeu Yggdrasil voit ses serveurs s'éteindre. Tout les joueurs ont apparemment déserté le monde du jeu, à l'exception de Momonga. Créateur et chef d'une des guildes les plus puissantes, il a refusé de se déconnecter et s'aperçoit bientôt que le jeu semble encore fonctionner. En effet, les personnages non joueur semblent doués d'une vie propre. Plus étrange encore, Momonga peut s'adresser à eux sans utiliser l'interface du jeu, et il a aussi conservé ses pouvoirs... Que se passe-t-il exactement ?