Чак должен вернуться в Стэнфорский университет, откуда его выгнали, чтобы помочь своему бывшему профессору, который, оказывается, является оперативником правительства, за которым охотятся в поисках совершенно секретного файла. Чак должен окунуться в воспоминания своих студенческих дней чтобы найти тайник профессора. По пути, Чак узнаёт шокирующую правду о себе и почему Брайс подставил его. Тем временем, Морган ведёт партизанскую войну с новым помощником менеджера.