Um dia, Yomogi Asanaka, um aluno do primeiro ano da Escola Secundária Fujiyokidai, encontra um homem misterioso chamado Gauma que afirma ser um “usuário de kaiju”. O súbito aparecimento de um kaiju é seguido pela entrada do robô gigante, Dynazenon. No lugar errado na hora errada estão Yume Minami, Koyomi Yamanaka e Chise Asukagawa, que são arrastados para a luta contra o kaiju.