Afin de sauver sa planète Râmetal, condamnée au froid glacial et à l'obscurité depuis que son soleil Râ l'a reniée, la reine Promithium n'a eu d'autre choix que de faire subir à son peuple le processus irréversible de la mécanisation après l'avoir expérimenté sur elle-même en guise d'exemple. Les deux filles de la reine, la douce Maetel et la guerrière Emeraldas ayant contredit ses desseins funestes, elles se voient contraintes de fuir Râmetal. Tandis qu'Emeraldas rejoint le capitaine Harlock et son fidèle compagnon Tochirô, Maetel choisit de s'exiler sur le Galaxy Express 999 qui parcourt l'Espace. Mais un jour, sa mère la rappelle pour qu'elle prenne sa succession...