Ambientado durante as aventuras de Seiya e os outros no Cavaleiros do Zodíaco clássico, Saintia Sho mostra um outro lado da batalha entre a deusa Atena e as forças do mal. A jovem Shoko é uma das Saintias - uma classe especial de Cavaleiros que serve diretamente a deusa da guerra, ora como aias, ora como guerreiras ferozes. Para salvar sua irmã e a Terra, a ela veste a Armadura de Equuleus e encara as forças de Éris, deusa da discórdia!