Masaru Daimon (também conhecido como Marcus Damon) é um garoto de 14 anos com temperamento forte entre gangues conhecidas por sua natureza violenta. Inesperadamente Agumon era um Digimon que havia escapado da organização governamental secreta DATS. Marcus e Agumon são desafiados a lutar, chegando a um empate, então eles acabam aceitando uns aos outros, tornando-se amigos.
Depois de derrotarem um ameaçador Kokatorimon, Marcus e seu novo amigo Agumon são presos e levados para o DATS. A missão principal desta organização é bloquear a ação de qualquer Digimon que aparecer no mundo real da forma mais silenciosa, levando-os de volta para o mundo digital e apagar as lembranças de cidadãos que tem vindo a ter um desses seres de forma ilegal. Portanto, a existência dos digimons é conhecida apenas pelos membros do DATS e seus envolvidos, que termina pela parte de Masaru. Junto com ele estão Thomas H. Norstein com Gaomon como um companheiro e Yoshino Fujieda, com sua parceira de infância, Lalamon.