Num “Japão feudal futurista e pós-apocalíptico”, onde quem conseguir o lenço simbólico “Número um” governará o mundo como um “deus”. No entanto, apenas aquele com o lenço "Número Dois" tem o direito de desafiá-lo. Afro Samurai, é o atual Número Dois, e viaja pelo mundo em busca de vingança, pelo atual Número Um que matou seu pai.