As crianças se dividem em dois grupos. O grupo de Taichi, Koshiro e Mimi chega a umas ruínas. Enquanto isso, o grupo de Yamato, Sora e Joe é emboscado no deserto. Ao tentar salvar um grupo de Digimons menores, descobrem que o deserto é território de um Digimon perfeito. Enquanto isso, Yamato guarda um segredo dos seus amigos.