Depois de descobrir que o homem que ela conhecia como Michael Vaughn está sendo investigado por suspeita de ser um agente duplo, Sydney começa a questionar se o relacionamento deles durante todo este tempo foi uma mentira.
Quando ela descobre que está grávida de Vaughn, decide descobrir a verdade sobre ele.
Enquanto isso, por culpa da traição de Jack por Irina, ele passa a se preocupar que sua filha tenha o mesmo destino que ele.