Après avoir repris le contrôle d'une des régions, le président Oliver et Chandler décident de reprendre les autres et envoient une équipe dans chacune d'elles afin d'intercepter leur dirigeant. Ils veulent également arrêter Allison Shaw, à la tête du coup d'État. Mais cette dernière réussit à se dérober et tente d'exterminer l'USS Nathan James et son équipage avant de prendre la fuite. Chandler fait face à un dilemme de taille et prend une décision radicale...