Les agents Ward et Fitz sont envoyés par le S.H.I.E.L.D. sur une mission des plus secrète. L’agent Coulson, seul membre de l’équipe possédant un accès de niveau 8 aux dossiers du S.H.I.E.L.D. refuse pourtant de donner des informations quant au sort de ses agents en infiltration. Skye et Simmons mènent alors l’enquête et ce qu’elles vont découvrir est bien différent de ce qu’elles imaginaient.