Alors que Sarah a été empoisonnée par Vivian, Chuck veut tout faire pour la sauver, même s'il doit lutter contre la CIA. Il décide de libérer Alexei pour connaître l'antidote de l'arme. Mais celui-ci est en cours de transfert vers un site secret de la CIA. Pendant son transfert, on retire à Alexei Volkoff l’Intersecret implanté en lui ce qui lui rend sa première identité. Par la suite, il réalise un premier antidote qui se révèle ne pas être assez puissant pour sauver Sarah...