Chise Hatori jest 15-letnią dziewczyną. Nie ma rodziny, specjalnych umiejętności, ani nawet nadziei na własne istnienie. Pewnego dnia zostaje przekazana magowi, nie-ludzkiej istocie, której początki sięgają czasów starożytnych... Ten bierze ją pod swoją opiekę, by szkolić ją na swoją uczennicę i wyjawia, że ostatecznie zostanie jego żoną. Od tego momentu koła zębate jej serca, które wydawały się zatrzymać na zawsze, zaczynają się powoli poruszać...