Rok 2030, japońskie miasto New Port. Realny świat coraz częściej stapia się ze światem wirtualnym. Codzienność wiąże się z wszczepianiem ludziom elektronicznych urządzeń. W zmechanizowanym świecie szerzy się fala cyberprzestępstw. Ich zwalczaniem zajmuje się specjalna grupa, Sekcja 9 dowodzona przez kobietę cyborga - Motoko Kusanagi. Motoko dysponuje nadludzką mocą, co z pewnością ułatwia jej kierowanie kompanią złożoną z byłych oficerów policji i detektywów. Już wkrótce grupa ta rozpoczyna bezwzględną walkę z kryminalistami.