Ziemia po apokalipsie stała się pustynią, a niedobitki ludzkości mieszkają w mobilnych miastach‑kopalniach zwanych plantacjami. Nadrzędnym celem ich istnienia jest wydobycie magmy, źródła energii wymaganego do przeżycia, bronionego przez potężnego wroga – klaxozaury. Jedyną skuteczną bronią w walce z nimi są roboty pilotowane przez szkolonych do tego celu nastolatków. Aby efektywnie sterować maszyną, dobierani są oni w pary, a poziom ich kompatybilności decyduje o tym, jak sprawnie będą działać na polu walki. W tym momencie poznajemy bohaterów, który zasiądą za sterami maszyn nazwanych od nazwiska ich twórcy Franxxami. Niestety w tej perfekcyjnie zaprojektowanej machinie wojennej nie ma miejsca dla słabych. Osoby takie jak Hiro, są skazane na niebyt jako nieprzydatne dla społeczeństwa. Jego życie ulegnie jednak całkowitej zmianie, gdy przypadkowo podczas walki zasiądzie za sterami maszyny pilotowanej przez tajemniczą i ekscentryczną dziewczynę o kodzie 002 zwaną „zabójcą partnerów”.