De serie gaat verder waar Terminator 2: Judgment Day ophoudt. Sarah en John zijn erin geslaagd om T-1000 te vernietigen. Hierna pleegt de Terminator zelfmoord om zo te voorkomen dat Skynet zijn technologie kan gebruiken. Sarah en John worden achtergelaten in een ingewikkelde en gevaarlijke wereld, waarin ze, als voortvluchtigen, geconfronteerd worden met de realiteit, waarin nog steeds een groot aantal gevaarlijke wezens/machines rondlopen.