Edward en Alphonse Elric zijn twee broers die begiftigd zijn met de gave van alchemie, de wetenschap om iets in iets anders te veranderen. Als hun moeder overlijdt besluit Edward menselijke transmutatie toe te passen. Het gaat echter verschrikkelijk mis. Alphonse verliest zijn lichaam en Edward verliest zijn linkerbeen. Edward weet Alphonse te redden door zijn ziel te hechten aan een harnas, maar ten koste van zijn arm. Edward en Alphonse gaan op zoek naar de Steen der Wijzen, waarmee zij hopen hun lichamen te kunnen herstellen.