Het seizoen 2 van Sea of Souls werd uitgezonden op BBC van samedi 8 janvier 2005 tot dimanche 23 janvier 2005. Het bestaat uit 6 afleveringen, de eerste heet "Amulet: Part 1" en de laatste "Empty Promise: Part 2".
Directeur d'un département de l'université de Clyde à Glascow, le professeur Douglas Monaghan, enquête sur les phénomènes paranormaux inexpliqués par la science. Avec ses acolytes, il identifie et valide ou non les documents qui passe entre leurs mains d'experts. Réincarnation, télépathie et évènements étranges sont le lot quotidien de ces chercheurs hors-pair.