Het seizoen 1 van Sea of Souls werd uitgezonden op BBC van lundi 2 février 2004 tot mardi 17 février 2004. Het bestaat uit 6 afleveringen, de eerste heet "Seeing Double: Part 1" en de laatste "That Old Black Magic: Part 2".
Directeur d'un département de l'université de Clyde à Glascow, le professeur Douglas Monaghan, enquête sur les phénomènes paranormaux inexpliqués par la science. Avec ses acolytes, il identifie et valide ou non les documents qui passe entre leurs mains d'experts. Réincarnation, télépathie et évènements étranges sont le lot quotidien de ces chercheurs hors-pair.