Queer Boys and Girls on the Shinkansen brengt tien filmmakers en kunstenaars samen die in hun werk consequent bevestigen wat het betekent om homo of lesbisch te zijn. Habakari koos tien filmmakers om elk een werk van vijf minuten te maken, ontwikkeld rond een homo- of lesbisch thema, en stelde de resulterende korte films in willekeurige volgorde samen om deze omnibusfilm te creëren. Het resultaat is een queerfilm, van queer filmmakers, voor een queer publiek. Elke korte film is zijn eigen korte verhaal en de stijlen variëren van drama en experimentele film tot animatie.