En Afrique, au XVIIIe siècle, Kunta, un Gambien qui rêve de rejoindre Tombouctou pour étudier à l’université, est enlevé pour être vendu comme esclave en Amérique. Le jeune homme est conduit à Annapolis, dans le Maryland, où il entre au service d'un riche propriétaire de Virginie nommé John Waller, qui le renomme Toby.