Le docteur Franklin doit s'occuper d'un jeune enfant extraterrestre, Shon, qui est mourant. Le seul moyen de le sauver consiste en une opération, mais les parents s'y refusent car d'après leurs croyances, si Shon est opéré, il perdra son âme. Pendant ce temps, le lieutenant-commandant Susan Ivanova, doit faire face aux attaques des Raiders.