Yato, un dio minore, sogna di diventare la divinità più riverita del mondo, con un grande tempio con tutte le comodità. Comunque essendo un dio senza un soldo ha ancora molta strada da fare e il fatto di venire scaricato del proprio aiutante non aiuta di certo. Un giorno, mentre cerca di rendersi utile, viene salvato da una liceale di nome Hiyori Iki, inconsapevole del suo status di divinità. Le cose si complicano quando, in seguito all'incidente, l'anima di Hiyori inizia a staccarsi dal corpo appena si addormenta. Per riportarla alla normalità Hiyori deve aiutare Yato a diventare un dio migliore in modo che possa effettivamente aiutarla.