La storia si svolge nella nazione insulare di Hinomoto. Lì gli umani sono costretti a rifugiarsi in delle fortezze, denominate stazioni, per fuggire dai Kabane, una sorta di zombie dal cuore di metallo, che infestano il territorio dell’intera nazione. Da una stazione all’altra ci si può spostare solo grazie alle Hayajiro, delle locomotive armate che fungono da unico collegamento.