La storia si svolge su un’isola che somiglia ad un'Irlanda futuristica, dove il "Fractale System" è sull’orlo del collasso. Il "Fractale System" si occupa di garantire l'indispensabile ad ogni abitante senza che egli debba lavorare. Sull'isola vivono sempre meno uomini, ma sono presenti molti "doppel" (letteralmente "doppioni"), ovvero dei robot simili ad avatar virtuali, e questo causa la noia del giovane protagonista, di nome Clain. Un giorno, durante una passeggiata in bici, Clain vede una ragazza di nome Phryne che sta fuggendo da una ragazzina e due uomini. Clain l'aiuta, e la invita a restare a casa sua. Ma il giorno dopo, la ragazza sarà scomparsa. Insieme ad una fanciulla di nome Nessa, Clain si imbarcherà in un'avventura alla ricerca di Phryne e del mistero del Fractale System.