La storia si svolge nel 2017 a.t.b.. Il Giappone affronta una crisi dopo la scomparsa di Zero, mentre l'Euro Universe forma la divisione speciale wZERO per contrastare il Sacro Impero di Britannia. Akito Hyuga, un pilota promettente, e Leila Malkal, ex aristocratica britanna, guidano i ribelli Wyvern in una battaglia per la libertà.