Fox Mulder e Dana Scully sono stati contattati da Tad O’Malley, un famoso teorico della cospirazione conduttore di programmi TV-TV che crede di aver scoperto una cospirazione significativa del governo. Con l'assistenza dell'FBI Asst. Dir. Walter Skinner, O'Malley cerca di ottenere l'aiuto degli ex agenti di X-Files Mulder e Scully, che da allora hanno interrotto i legami con l'FBI. Attraverso O 'Malley vengono introdotti a Sveta, una possibile rapita dagli alieni che condivide informazioni scioccanti con loro che sfideranno tutto ciò che Mulder ha mai creduto sull'esistenza di alieni e il ruolo del governo nel coprirli.