Nel 1970, un incidente con un UFO dà origine ad una serie di riunioni internazionali segrete. Mentre è in viaggio per una di queste riunioni, una Rolls Royce con a bordo il colonnello Straker ed il Generale Henderson è attaccata da un UFO. Un salto di dieci anni ed ecco la SHADO completamente operativa, con Straker al comando. Il colonnello Freeman è incaricato di pilotare un aereo SST che trasporta un nuovo rivoluzionario dispositivo di ricerca nello spazio profondo (l'apparato UTRONIC) ed il suo staff di progettisti. Durante il volo un UFO viene rilevato ma gli intercettori non riescono a distruggerlo. L’UFO si avventa sullo SST, ma SKY1 riesce ad intercettarlo. Un alieno sopravvive all’impatto con l'oceano ed è trasportato al quartier generale della SHADO. Quali segreti potrà rivelare??