Un adolescente si presenta al comando Stargate affermando di essere il colonnello O'Neill, e il DNA sembra dargli ragione. Grazie all'aiuto di Jacob Carter, si scopre che il ragazzo è in realtà un clone, e che in breve tempo è destinato a morire. Indagando su altri casi simili, il dottor Jackson e Teal'c cominciano a sospettare che possa essere stata opera degli asgard.