Mentre il colonnello O'Neill è con i tok'ra, Carter riceve una telefonata nel mezzo della notte da parte di uno scienziato, che il giorno dopo viene trovato ucciso. La SG-1 si reca per indagare in una cittadina, dove gli abitanti sembrano apatici e si comportano in modo diverso durante la notte. Grazie all'aiuto di un guardiano notturno riescono a trovare quella che sembra un'astronave in costruzione, i cui progetti sono scritti in goa'uld; Teal'c e Jonas vengono rapiti da alcuni agenti federali, che considerano quella cittadina un esperimento, ma gli abitanti sembrano sapere di essere controllati.