Ben sembra ”incassare” abbastanza bene la diagnosi di leucemia, cosa invece difficile da accettare per la sorella Jordan. Anche J.D. non sa come comportarsi, mentre il Dr. Cox appare padrone della situazione. Ma le cose cambiano appena Ben inizia i trattamenti di chemioterapia: Cox non regge e si rifiuta di far visita all'amico. Grazie all'intervento di J.D., Cox mette da parte le sue paure e torna da Ben che, grazie alla chemioterapia, sta molto meglio ed è in via di guarigione.Nel frattempo Turk riceve un grande colpo al suo ego, scoprendo che non è lui ”il numero uno” tra gli assistenti ma Todd. Mentre Elliot è vittima di un tranello del Dr. Kelso: dopo l'ennesimo rimprovero da parte di quest'ultimo, ha modo di riscattarsi compilando una valutazione anonima sul primario. Con l'aiuto di Carla e contando sull'anonimato, la giovane dottoressa esprime su carta tutto il suo disprezzo, ma il bello viene quando Elliot scopre che Kelso in realtà ha chiesto quella valutazione solo a lei…