Proprio ad Halloween, Malcolm è malato e deve restare a letto. Reese e Dewey se ne vanno senza di lui, ma sono costretti da Lois a portare Jamie con loro. Nel frattempo, anche Malcolm e Hal vivono un vero Halloween a casa: dopo che Hal ha appreso che un assassino viveva nella loro casa anni fa e aveva ucciso tutta la sua famiglia, si convince che i fantasmi infestano ancora la casa oggi.