En su día a día, Sam, Clover y Alex son simples chicas de instituto, pero en realidad son agentes secretos: profesionales del espionaje que trabajan para WOOHP, una organización clandestina dedicada a salvar a la humanidad. Cuando su superior, Jerry, requiere su ayuda, las despliega en misiones, proporcionándoles diversos dispositivos tecnológicos que les ayuden a llevar a cabo sus investigaciones.