Fenómenos es una serie sobre un detective de “milagros” que, cansado de ver como se tambalean su propias creencias se embarca en el viaje más sorprendente de su vida. Como investigador de fenómenos extraños, Paul (Skeet Ulrich) siempre acaba con el mismo resultado: una explicación convencional y una multitud de creyentes decepcionados. Su propia fe va flaqueando cada día y su única creencia es que "todos estamos solos". Entonces ocurrirá algo que lo cambia todo.
Tommy Ferguson, un niño con el poder de curar, salva la vida de Paul. Pero Tommy deberá paga un alto precio por este milagro: su propia vida. Justo antes de la muerte del niño – y la segunda oportunidad de Paul – ambos ven las palabras "Dios está ahora aquí" escritas en la sangre de Paul. Desde entonces, nada será nunca igual. Mientras Paul trata de comprender lo que le ha ocurrido, se une a él Alva Keel (Angus MacFadyen), un ex profesor de la Universidad de Harvard que investiga también fenómenos paranormales.
Ambos piensan que el otro posee la llave para descubrir un misterio aún mayor – el número creciente de “hechos extraños” que ocurren en el Mundo y que pueden presagiar la llegada inminente de un sobrecogedor y mortal acontecimiento a escala mundial.
Con la ayuda de una ex policía, Evelyn Santos (Marisa Ramírez), estos tres investigadores viajarán a todas partes y harán cualquier cosa por descubrir lo inexplicable, en un intento de encontrar la solución a la inminente “oscuridad”... antes de que sea demasiado tarde.