Cuando Iori Kitahara se marcha a la universidad, elige instalarse en la tienda de buceo de su tío en Izu, conocida como Grand Blue. Iori está ansioso por comenzar su vida de estudiante, rodeado por el rugido de las olas, el intenso sol y su primo que vive con él. Sin embargo, Iori conoce a un grupo de tipos duros apasionados por los juegos de tira piedra-papel-tijera, y se une al club de buceo de la universidad, Peek-a-Boo.