Dos atípicos muchachos descubren sus originales destinos y comienzan a comprander su lugar en el plan maestro de los alienigenas.
1958:Russell Keys, víctima de varias abducciones alienígenas, lucha por mantener a su de 13 años, Jesse, a salvo de su mismo destino; hasta que descubre que el chico ha sido tomado también por extraterrestres anteriormente. En Roswell, el Coronel Owen Crawford ha estado fracasando en su misión de descubrir el secreto que se esconde detrás de la nave extraterrestre que encontró diez años atrás. Y decide que la respuesta podría hallarse en Jacob Clarke, el hijo especial de Sally Clarke, que parece poseer extraordinarios poderes.