Se ha emitido una orden de arresto a nivel nacional para Goemon, quien no solo robó un banco sino que también mató a puñaladas a un guardia de seguridad. El Zantetsuken en la mano de Goemon no tiene nada de la sangre nublada en la hoja que indicaría apuñalar a una persona. Este es el trabajo del archienemigo de Goemon, Nidaemon. Hay dos Zantetsukens, una variedad masculina y otra femenina. Según la tradición, a menos que las dos hojas se junten una vez cada 300 años, la hoja macho más grande perderá su potencia. Esta vez es medianoche. ¿Se aclarará la desgracia?