Mientras recorre las alcantarillas de Nueva York, Nick Tatopoulos descubre que uno de los huevos de Godzilla ha sobrevivido. La cría que emerge escapa y cuando el equipo la encuentra de nuevo, se ha convertido en un sub-adulto masivo (pero afortunadamente inofensivo). Mientras el equipo intenta estudiar al nuevo Godzilla, el ejército de los Estados Unidos, respondiendo a una serie de desapariciones en Jamaica, ¡ataca!