Sarah a téléchargé l’Intersecret dans sa mémoire pour échapper à un guet-apens. Avec l'aide de Casey, elle sauve Chuck. Cependant, l’Intersecret commence à attaquer son cerveau et Ellie cherche un moyen de la sauver.
Pendant ce temps, Jeff et Lester sauvent le « capitaine Trop Top », Morgan et Alex. Ils apprennent ainsi le véritable métier de leurs collègues.
Plus tard, Quinn réussit à kidnapper Sarah et lui efface l'intégralité de sa mémoire. Il décide alors de l'assigner à une mission : « Tuer Chuck ».