L'équipe de Jim Phelps est chargée de libérer le docteur Rojak, qui travaille sur la construction d'un missile à la puissance sans précédent, et son épouse Anna, prisonniers des autorités d'un pays de l'Est. Leurs ravisseurs les tiennent bien à l'abri dans un laboratoire secret enfoui à mille pieds sous terre. Dans le même temps, une autre organisation gouvernementale, hostile au travail de Rojak, envoie un tueur professionnel, Ventlos, pour le supprimer. Jim, Cinnamon et leurs collègues entreprennent alors d'infiltrer le bunker afin de sauver le professeur et sa femme, d'une part, et de détruire l'engin, d'autre part...