Mehrere Jahre nach dem Ende der Anime-Serie Dragon Ball Z.
Pilaf will die Kristallkugeln nutzen, um die Welt zu beherrschen. Er hat die Existenz von alten Dragon Balls entdeckt, die schwarze Sterne anstelle von orangefarbenen als Ornamente haben! Zusammen ermöglichen sie es Pilaf, Shenron zu beschwören, der rot ist. Pilaf verfehlt seinen Wunsch und Shenron verwandelt Goku in ein Kind. Diese bösen Dragon Balls zerstören nach einem Jahr den Planeten, auf dem der Wunsch geäußert wurde. Goku hat ein Jahr Zeit, um sie wieder zu vereinen und den Untergang der Erde zu verhindern. Er macht sich mit Trunks und Pan auf die Suche nach den Kristallkugeln, die über die ganze Galaxie verstreut sind.
Sie treffen auf einen Roboter namens Guigui und einen Professor, Myû. Dieser erschafft Baby, eine Maschine, die ihn beschützt. Vegeta, Goten, Gohan und Oob sind ebenfalls anwesend. Goku entwickelt eine neue Form von Super Saiyan, als er gegen einen alten "Feind" kämpfen muss.