Die Epidemie scheint nicht mehr zu stoppen. Schlimmer noch, die Verursacher scheinen aus der Chefetage zu kommen. Während Richard Tyler mit den noch Gesunden aus dem 4400-Center in den Untergrund geflohen ist, zieht NTAC aus, um jeden einzelnen 4400 in Quarantäne zu stecken. Schließlich stoßen Diana und Tom auf die entsetzliche Wahrheit hinter dem Ganzen. Mit dem neuen Wissen im Rücken stiften sie Kevin Burkhard an, ein Heilmittel zu finden, doch kommt das noch rechtzeitig? Als die ersten 4400 der Epidemie zum Opfer fallen, scheint es bereits zu spät zu sein.