Nachdem Sonic X in eine andere Galaxie geschleudert wurde, landet er in einem Swimmingpool, aus dem ihn ein kleiner Junge namens Chris rettet. Chris ist es auch, der Sonic erklärt, dass er sich nun auf der Erde befindet. Gemeinsam mit seinem Opa will Chris alles tun, um Sonic zu helfen. Das bedeutet, dass sie zunächst Sonics Freunde Cream und Cheese aus der Militärbasis befreien müssen ...